INGÉNIEUR-E EN BIOINFORMATIQUE ET NEUROSCIENCES - H/F

Description :


Dans le cadre des activités de recherche de l'équipe de Homaira NAWABI « Du développement à la réparation» de l'unité de rechercche Grenoble Instititut Neurosciences, le/la bioinformaticien(ne) participera à un projet visant à analyser et intégrer des données biologiques à haut débit (single nuclei RNA seq ; analyses haut débits déjà publiés, données de protéomique) pour mieux comprendre les mécanismes biologiques mis en jeu lors de la formation de circuits neuronaux

Activités principales :

* Analyse de données biologiques : traitement, nettoyage et normalisation de données issues de cytométrie en flux et de plateformes protéomiques
* Intégration multi-omique : mise en oeuvre d'approches d'intégration de données hétérogènes (biologiques et cliniques).
* Analyse statistique et modélisation : analyses exploratoires, analyses multivariées,clustering, réduction de dimension, identification de signatures biologiques et découverte de biomarqueurs.
* Développement de pipelines reproductibles : création et maintenance de workflows d'analyse sous R/Python
* Interaction avec l'équipe : échanges réguliers avec biologistes, participation aux réunions de projet.
* Rédaction et communication scientifique : préparation de figures, rapports, documentation, contributions aux publications.
* Gestion des données : organisation, documentation et archivage des données selon les bonnes pratiques (FAIR, traçabilité).




Profil recherché :


FORMATION

* Diplôme de niveau BAC+5

CONNAISSANCES

* Maîtrise des concepts et méthodes en BIOINFORMATIQUE, BIOSTATISTIQUES et analyse de données omiques.
* Solides compétences en R ET/OU PYTHON (ou autre langage de programmation adapté à l'analyse de données).
* Expertise en TRANSCRIPTOMIQUE et/ou PROTÉOMIQUE, avec une bonne connaissance des deux domaines appréciée.
* Connaissance des approches et méthodes d'INTÉGRATION DE DONNÉES MULTI-OMIQUES.
* Bonne compréhension des principes de la BIOLOGIE DES SYSTÈMES ; des connaissances en NEUROSCIENCES seraient un atout.
* Maîtrise des principes FAIR et des bonnes pratiques de gestion et de valorisation des données scientifiques.

COMPÉTENCES TECHNIQUES

* Analyser et interpréter des jeux de données biologiques complexes et volumineux.
* Développer, automatiser et documenter des pipelines d'analyse reproductibles.
* Mettre en œuvre des méthodes statistiques avancées adaptées aux données omiques.
* Produire des visualisations pertinentes et communiquer efficacement des résultats complexes.
* Rédiger des protocoles, rapports d'analyse, documentations techniques et publications scientifiques.

QUALITÉS ATTENDUES

* Rigueur scientifique et sens de la qualité.
* Esprit d'analyse et de synthèse.
* Autonomie et capacité à piloter des projets d'analyse de données.
* Aptitude à travailler au sein d'équipes pluridisciplinaires associant biologistes, cliniciens et data scientists.
* Excellentes qualités relationnelles et de communication, à l'écrit comme à l'oral.
* Sens de l'organisation, gestion des priorités et capacité d'adaptation.
* Force de proposition et aptitude à anticiper et résoudre les problématiques techniques ou scientifiques.

EXPÉRIENCE SOUHAITÉE

* Expérience significative en analyse de données omiques (transcriptomique, protéomique, cytométrie, etc.).
* Expérience en INTÉGRATION MULTI-OMIQUE ou en DATA SCIENCE APPLIQUÉE AUX SCIENCES BIOMÉDICALES.
* Expérience du travail dans un environnement de recherche académique ou en collaboration avec des équipes biologiques et/ou cliniques.
* Une expérience dans le domaine des NEUROSCIENCES